1. Il Rettore, per quanto di competenza, promuove ed attua le strategie di sviluppo dell'Ateneo.
2. In particolare, il Rettore:
- rappresenta l'Università;
- garantisce l'autonomia didattica e di ricerca nell'Università;
- emana lo Statuto, gli atti di modifica dello stesso ed i regolamenti che disciplinano l'organizzazione e la gestione dell'Ateneo;
- convoca e presiede il Senato Accademico ed il Consiglio di Amministrazione;
- coordina le attività e sovrintende all'esecuzione delle deliberazioni del Senato Accademico e del Consiglio di Amministrazione;
- in caso di necessità ed urgenza può adottare provvedimenti di competenza del Senato Accademico e del Consiglio di Amministrazione, sottoponendoli a ratifica del competente organo nella prima riunione immediatamente successiva;
- stipula convenzioni e contratti connessi con le attività di indirizzo e di programmazione o, in ogni modo, con le attività di ricerca e di didattica, salvi quelli di competenza di specifici organi e soggetti;
- provvede alla presentazione del bilancio preventivo e del conto consuntivo, corredandoli con apposita relazione;
- predispone la relazione annuale sullo stato della didattica e della ricerca nell'Ateneo;
- indice ogni due anni, per discutere della situazione e delle linee di sviluppo dell'Università, un'apposita Conferenza di Ateneo;
- relaziona periodicamente al Ministero dell'Università sul funzionamento dell'Ateneo;
- vigila sull'osservanza di tutte le norme concernenti l'ordinamento universitario e dà esecuzione agli atti di indirizzo e coordinamento adottati dal Ministero competente per l'Università;
- ha l'alta vigilanza sulle strutture dell'Università;
- esercita tutte le altre attribuzioni che gli sono demandate dallo Statuto, dai regolamenti e dalla vigente normativa sull'ordinamento universitario.
Il Rettore può nominare due Prorettori: di questi, il primo - Prorettore vicario -, scelto tra i professori di ruolo di prima fascia a tempo pieno, sostituirà il Rettore in caso di assenza o di impedimento, il secondo, scelto tra i professori di ruolo a tempo pieno, avrà delega per la vigilanza sui servizi amministrativi e contabili. Il Rettore può delegare, altresì, la trattazione istruttoria di specifiche materie a professori di ruolo e a ricercatori dell'Università del Molise.